Aminosäuren in alpha-Helix?

Hallo zusammen,

darf man dieses L-Alanin in beiden Schreibweisen darstellen?

In einer rechtsgängingen alpha-Helix, zeigt die Seitenkette ja nach außen, wenn L-Aminosäuren verbaut sind. Ist sie beim Menschen deshalb häufiger als die linksgängige Helix, weil im Körper v.a. L-Aminosäuren vorkommen?

Das grau hinterlegte CH3 wäre meine Seitenkette. Ist das richtig so?

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botanicus
2 months ago

Im Körper gibt es nicht vor allem sondern ausschließlich L-Aminosäuren. Und eine räumliche Schreibweise ist nur richtig, wenn sie die L-Form zeigt. Das ist in beiden Darstellungen der Fall.

botanicus
2 months ago
Reply to  profifrager

okay, dann ist mir diese entgangen. sorry. Aber an Proteinen ist die D-Form nicht beteiligt, oder?

Die untere Schreibweise ist ja genau dasselbe, nur dass statt eines Keils nach vorne eine gestrichelte Linie mit einer Bindung nach hinten abgebildet ist, um die Geometrie zu verdeutlichen. Dreibindig dargestellte Asymmetriezentren finde ich eh unglücklich; warum ist das Wasserstoffatom zur Verdeutlichung nicht mit eingezeichnet?

botanicus
2 months ago

Ja, das denke ich auch. Man bräuchte ja sonst eine spezielle t-RNA für D-Formen (und welches Codon soll dafür gelten?). Aber ein späterer Ersatz aus der Kette heraus scheint mir schwierig (wozu auch?), bestenfalls eine Isomerisierung. Von einer D-L-Isomerase hätte ich noch nie etwas gehört. Höchstens per Waldenscher Umkehr, wenn am C2 eine SN-Reaktion geschieht, aber dann entsteht sowieso eine andere AS. Nettes Gedankenspielchen…

Der Darstellung bin ich mir indes sicher, die Stereochemie ist eindeutig. Beide kann man sich in die Fischerprojektion gedreht denken (eigentlich wäre das eh die sauberste Darstellung).